消化实验室隶属于第四军医大学西京消化病医院，创建于1954年，是全国首批硕士和博士学位授权学科。1995年 2000年先后被命名为全军消化病研究所和“重中之重”建设学科。1998年成为 “长江学者奖励计划”岗位学科，樊代明、吴开春、刘杰和聂勇战教授分别受聘为长江学者特聘教授。2006年批准为肿瘤生物学国家重点实验室。实验室现任主任樊代明教授，中国工程院院士，中华消化病分会主委，世界胃肠病大会主席，“973”首席科学家，杰出青年基金获得者，国家科技进步一等奖第一完成人。吴开春教授，杰出青年基金获得者，长江学者特聘教授，中华消化病学分会委员，亚太地区胃肠病学会常务理事。目前实验室固定人员中院士1名，硕士博士导师教授15名。

实验室拥有大量先进仪器，拥有美国BD公司流式细胞仪1台、Roache 公司和MJ公司荧光定量PCR仪各1台、Bio-rad凝胶电泳分析仪、Thermo Fisher全自动多功能酶标仪、SORVA高速低温离心机、forma细胞培养箱11台，荧光显微镜--正置、倒置--各1台及照相系统一套（OLYMPUS）等，为实验研究提供良好的实验技术平台。

近五年来获得国家“973”专项 1项，“863”专项两项。国家自然科学基金重点项目 2项，自由项目 54项，总经费近5300万元。 2008年获得国家科技进步一等奖，2009年获得军队医疗成果一等奖。近五年发表SCI论文172篇，其中影响因子10分以上 15篇， 5分以上 20篇。出版专著9部 、教材1部。获得国家新药证书和发明专利5项。实验室面积4000平方米，仪器设备价值700万元。